1977年由胜夫出版社出版第一本书《莲花开落》，皇冠出版社出版《蝴蝶无须》

　　1978年由德馨室出版社出版《雏鸟啼》

　　1979年由四季出版公司出版《山中传奇》，皇冠出版社出版《香火》

　　1981年由世界文物供应出版社出版《林清玄自选集》

　　1982年由九歌出版社出版《永生凤凰》，时报出版公司出版《谁来吹醒文化》《难遣人间未了情》

　　1983年由九歌出版社出版《鸳鸯香炉》《白雪少年》

　　1984年由时报出版公司出版《文化阵痛》《**的号角》，东大出版公司出版《乡事》，信谊基金会出版《与鬼捉迷藏》，自立晚报出版公司出版《金色印象》，前卫出版社出版主编的《1983**散文选》

　　1985年由九歌出版社出版《迷路的云》《玫瑰海岸》

　　1986年由九歌出版社出版《紫色菩提》，文建会出版《传统节日》，希代出版公司出版《雪口之火》《雪已经开始下了》，骏马文化事业社出版《大悲与大爱》，时报出版公司出版《宇宙的游子》

　　1987年由光复书局出版《清玄人物集》《清玄文化集》，希代出版公司出版《海的女儿》，九歌出版公司出版《凤眼菩提》《星月菩提》

　　1988年由九歌出版社出版《如意菩提》《拈花菩提》

　　1989年由九歌出版社出版《清凉菩提》《宝瓶菩提》《菩萨宝偈》《好雪片片》，健行文化出版社出版《天边有一颗星星》

　　1990年由九歌出版社出版《红尘菩提》，汉艺色研出版社出版《双头甜》

　　1991年由健行文化出版社出版《心海的消息》，洪健全出版社出版《身心安顿》，九歌出版社出版《随喜菩提》《会心不远》，汉艺色研出版社出版《蓬来香》，皇冠出版社出版《海岸小品》，圆神出版社出版《在苍茫中点灯》，九歌出版社出版主编的《圣严法师法鼓集》，圆神出版社出版主编的《禅门三要》

　　1992年为圆神出版社策划出版“现代佛典系列”，被誉为“影响佛教复兴的关键人物”；由圆神出版社出版《清净心看世界》《以有情觉有情》，洪建全基金会出版《烦恼平息》，音乐中国出版社出版有声书《老先觉的话》，皇冠出版社出版《云在青天》《水在瓶》，健行文化出版社出版《越过沧桑》，九歌出版社出版《一滴水到海洋》《有情菩提》；“菩提系列”十册出齐。

　　1993年音乐中国出版社出版《呀！弘一》，健行文化出版社出版《比景泰蓝更蓝》《热气球上升》，新一基金会出版童话《王子与椅子》《最后的锣鼓声》，圆神出版社出版《欢喜心过生活》，皇冠出版社出版《活眼金睛》，自费出版石头专著《补天》。

　　1994年圆神出版社出版《平常心有情味》、有声书《打开心内的窗》，洪健全文化出版社出版《莲花香片》《平安如意》，九歌出版社出版《处处莲花开》，皇冠出版社出版《宛如云水》

　　1995年九歌出版社出版林清玄第一百部作品《多情多风波》，格林出版公司出版童话《纸牌王国》《鸟巢》，皇冠出版社出版《喜悦之路》

　　1996年圆神出版社出版《柔软心无挂碍》、有声书《走向光明的所在》，洪健全文化出版社出版《清音五弦》

　　1997年圆神出版社出版《真正的爱》，清音出版社出版有声演讲书《生活·智慧·爱》，共四大套、四十八盘。

　　1998年圆神出版社出版《生命中的龙卷风》，格林出版公司出版《玄奘》

　　1999年圆神出版社出版《突破人生困境的寓言》，**知识出版社出版简体字版《打开心内的门窗》《走向光明的所在》、由走向《光明的所在》部分内容结集而成的《飞向蓝天的白云》、由繁体版《生命中的龙卷风》更名的《可以预约的雪》《心的丝路》《温一壶月光下酒》《莲花香片》《寻找幸运草》《迷路的云》《鸳鸯香炉》、由《烦恼平息》更名的《漫步人生的花园》、由《身心安顿》更名的《寻找心灵的故乡》

　　2000年圆神出版社出版《探索人生方向的寓言》《点燃人生希望的寓言》《体会人生真味的寓言》，九州出版社出版《心的菩提》《情的菩提》

　　2001年九州出版社出版《以爱为灯》《以美为光》，台海出版社出版《飞跃沙漠的河》

　　2003年九州出版社出版《天心月圆》《清音五弦》《淡品人生》

　　2006年河北教育出版社出版《在云上》

　　2007年河北教育出版社出版《林泉》《清欢》《玄想》，重新修订出版《心的菩提》《情的菩提》